基于药效团和分子对接技术对甘草中AChE抑制成分的虚拟筛选

作者：刘广欣; 赵泽丰; 解景; 桑杰; 梁业飞; 钱明成; 李翠芹^*

来源：中国中药杂志, 2020, 45(10): 2431-2438.

DOI：10.19540/j.cnki.cjcmm.20191112.201

• 甘草
• AChE抑制剂
• 抗痴呆
• 药效团
• 分子模拟对接

该文对甘草中潜在作用于乙酰胆碱酯酶(acetylcholinesterase,AChE)靶点的抗痴呆活性物质进行研究,阐明其药效物质基础。通过收集文献中报道的具有AChE抑制活性的化合物信息,建立基于AChE配体的HipHop药效团模型,收集文献中报道的甘草中的成分并建立化合物库,对甘草中的成分与药效团进行匹配,随后采用柔性对接(flexible docking)手段对匹配到的小分子化合物与AChE靶点(PDB ID:4EY7)进行对接并评估其相互作用。通过文献检索共得到甘草中所包含的化学成分44种,建立甘草化合物库。随后通过测试集验证选出优选药效团04用于对甘草化合物库的虚拟筛选,经过匹配后得到6种甘草中潜在的抗AChE成分。随后通过分子模拟对接分析了6种化合物与AChE的相互作用情况,预测所得甘草抗AChE成分与已有文献相符,表明基于药效团和分子对接技术手段探讨甘草中AChE抑制作用的成分具有一定的准确性。

• 单位
  西北大学; 生命科学学院; 陕西师范大学; 常州大学