硇洲岛海胆可培养细菌的多样性

作者：黄苛; 张丽; 刘祝祥; 陈奇辉; 彭清忠; 李文均; 崔晓龙; 陈义光

来源：微生物学报, 2009, (11): 1424-1429.

DOI：10.13343/j.cnki.wsxb.2009.11.008

• 马粪海胆
• 可培养细菌
• 16S rRNA基因
• 系统发育分析
• 多样性

【目的】研究南海硇洲岛马粪海胆(Hemicentrotus pulcherrimus)可培养细菌多样性。【方法】采用纯培养法和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析对样品中细菌(含放线菌)多样性进行研究。【结果】用补充0～2.0mol/LNaCl的MA、ISP2、NA、SWA和HAA培养基从海胆样品中分离到106株细菌菌株,根据形态观察和部分生理生化实验结果去冗余,选取34个代表性菌株进行基于16S rRNA基因序列的系统发育多样性分析。结果表明,这些分离菌株代表21个物种,属于3个大的系统发育类群(Firmicutes,Actinobacteria,Gamma-Proteobacteria)的10个科、17个属。多数菌株属于Firmicutes门(21株,58.8%)和Actinobacteria门(9株,26.5%)。大多数菌株与其系统发育关系最密切的已知物种的典型菌株之间存在一定的遗传差异(16S rRNA基因序列相似性为99.6%～99.9%),其中至少有5个菌株(JSM076033,JSM076056,JSM076093,JSM078063和JSM078169)代表潜在的新分类单元(potential new taxa)。【结论】研究结果表明,南海硇洲岛海胆中存在较为丰富的细菌多样性,并且潜藏着较多的新的微生物类群(物种)。

• 单位
  云南大学; 吉首大学; 云南省微生物研究所