热应激前后湖羊下丘脑差异表达新基因的筛选与注释

作者：李隐侠; 冯小品; 张莉; 张俊; 钱勇; 孟春花; 王慧利; 仲跻峰; 曹少先^*

来源：江苏农业学报, 2019, 35(02): 363-369.

• 湖羊
• 热应激
• 下丘脑
• 转录组测序
• real-time PCR

湖羊是中国南方唯一的绵羊品种,耐湿热是其重要的特色性状之一。但目前关于其耐湿热机制尚不清楚。本研究以湖羊为研究对象,通过转录组测序技术鉴定热应激前后下丘脑组织中的新基因及其差异表达,并通过不同数据库比对和分析,进行新基因功能注释。结果表明,热应激前后在湖羊下丘脑组织中共检测到1 990个新转录本,通过功能注释,发现1 344个新基因。在热应激组和对照组湖羊中,差异表达新基因186个,其中130个新基因表达上调,56个新基因表达下调,通过比对发现这些基因分别与细胞免疫、繁殖、生长代谢及相关信号通路相关。Real-time PCR验证试验结果表明,10个热应激前后表达差异基因中有9个与转录组测序结果一致。这些结果为绵羊基因组的进一步完善及基因功能的挖掘提供了一定的数据基础,为全面解析绵羊热应激的分子机制提供更多的依据。

• 单位
  江苏省农业科学院; 农业部