‘桂柚1号’及其母株全基因组变异差异分析

作者：刘冰浩; 丁萍; 张社南; 袁洁; 区善汉^*; 梅正敏; 贺申魁

来源：分子植物育种, 2022, 20(23): 7720-7728.

DOI：10.13271/j.mpb.020.007720

• 桂柚1号
• 沙田柚
• 全基因组
• 变异差异

为揭示‘桂柚1号’(Citrus grandis Lour.)优良品种的全基因组变异类型，本研究采用高通量重测序技术，对当前优良变异品种‘桂柚1号’及其母株‘沙田柚’开展全基因组重测序，测序深度53.88X和57.73X。与‘矮晚柚’(C. grandis Lour.)参考基因组比对，分别检测到2 985 308和2 997 229个单核苷酸多态位点，即494 577和497 051个小片段插入缺失位点(InDel)以及13 835和14 602个结构变异(SV)，共导致4 999和5 063个基因变异。KEGG代谢通路分析发现，在环境适应、碳水化合物代谢、能量代谢、萜类化合物和聚酮化合物的代谢及其他次级代谢物的生物合成方面存在基因变异。本研究为柑橘品种选育、鉴定及性状形成等相关分子标记开发和遗传改良提供理论依据和数据支持。

• 单位
  生命科学学院; 广西师范大学; 湖南农业大学; 广西特色作物研究院