本发明公开了一种旋转式海绵体同步截污和清洗的运行方法,其特点是采用串联或并联将旋转式海绵体装置安装在道路两侧或小区雨水管网末端,所述挡板的排水口与市政雨水管网、附近城市水体或回用水池相连;所述挡板的进水口由水泵与就近干净水源、消防水池或给水管网接驳,驱动机构连接可编程逻辑控制器,实现雨水径流同步截污和清洗。本发明与现有技术相比具有结构简单,使用方便,在实现雨水径流高效截污的同时可以有效防止填料堵塞,对雨水径流污染具有净化作用,有效防止径流污染导致的城市水体黑臭问题。