利用转录因子结合位点识别人类肿瘤特异性启动子研究

作者:王琦; 李伟鹏; 黄仲曦; 杨琳
来源:第一军医大学学报, 2004, (11): 1323-1325.
DOI:10.3321/j.issn:1673-4254.2004.11.020

摘要

目的研究应用计算机技术对人类肿瘤特异性启动子进行识别、预测。方法通过收集肿瘤特异性启动子序列、转录因子结合位点序列、非肿瘤启动子序列3种数据集合,利用转录因子结合位点在不同序列集合中的密度求出各位点的对应密度比,确定识别特征,进行肿瘤特异性启动子的识别。结论该方法具有较高的准确性,在保证对训练集合90%以上的识别率的情况下,对测试集合的识别率达到80%以上。

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