全基因组结合位点分析揭示LAZY1控制水稻分蘖角度的下游调控网络

作者：朱亮; 薛蓬勃; 李国强; 黄婧^*; 金健^*

来源：基因组学与应用生物学, 2022, 41(07): 1539-1549.

DOI：10.13417/j.gab.041.001539

• 水稻
• 分蘖角度
• LAZY1
• 染色质免疫共沉淀测序
• 下游基因

水稻(Oryza sativa L.)是世界上最重要的作物之一，而分蘖角度是水稻的重要性状，它影响着水稻的光合作用面积。LAZY1是水稻中第1个被鉴定的调控水稻分蘖角度的基因，然而LAZY1作为转录因子，它结合的下游基因尚不清楚。本研究通过染色质免疫共沉淀测序(ChIP-Seq)技术，研究LAZY1在全基因组水平的结合位点，分析其可能调控的基因。根据ChIP-Seq结果，我们发现大量的peaks除了坐落在基因间隔区外，还坐落在基因的启动子上，暗示LAZY1可能调控大量下游基因的表达。通过GO功能分析和KEGG富集分析，发现LAZY1可能调控一类影响分子代谢和修饰的基因。经过筛选，我们获得了51个LAZY1下游候选基因，根据其中一些已被报道的基因，分析了LAZY1的下游调控网络，为今后的水稻分蘖角度研究提供参考。

• 单位
  亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室