COPD动态miRNA表达谱的构建及生物信息学分析

作者：谢丽华; 孙圣华; 卢俊娟; 林桦

来源：基础医学与临床, 2016, 36(06): 739-746.

DOI：10.16352/j.issn.1001-6325.2016.06.004

• 慢性阻塞性肺疾病
• miRNA
• 微芯片
• 生物信息学

目的构建慢性阻塞性肺疾病(COPD)动态大鼠模型不同时期肺组织miRNA表达谱,并对差异表达的miRNAs进行生物信息学分析,以了解COPD发生发展中miRNAs变化规律及可能涉及相关机制。方法 1)将大鼠随机分为对照组、吸烟2、4、6、8周组和15周+气管内滴注猪胰弹性蛋白酶组,每组5只,病理学观察其形态学改变;2)取对照组、吸烟4周和15周+气管内滴注猪胰弹性蛋白酶组大鼠肺组织各2例,用于miRNA表达谱芯片分析;3)实时荧光定量PCR法验证芯片数据;4)运用生物信息学法对miRNA表达谱进行靶基因预测及聚类分析。结果 1)成功建立COPD动态大鼠模型,该鼠肺组织早期以出现炎性细胞浸润为主,晚期出现肺气肿改变的动态病理变化;2)成功建立miRNAs动态表达谱,熏烟4周组共30个miRNAs异常表达,熏烟15周组共37个miRNAs异常表达;3)实时荧光定量PCR法证实miR-146a、miR-21、miR-206和miR-181a变化趋势与芯片一致;4)生物信息学分析显示异常表达的miRNAs可能与COPD发病机制密切相关。结论 1)成功构建动态COPD大鼠模型及miRNA表达谱。2)通过生物信息学分析异常表达的miRNA可能在COPD发病机制中发挥重要作用。

• 单位
  中南大学湘雅三医院