药食两用中药里潜在抗COVID-19活性成分的虚拟筛选及分子动力学模拟计算

作者：陈芯悦; 谢思全; 陈淑钿; 陈炜莉; 刘小刚; 荣菡; 甘露菁^*

来源：广东化工, 2023, 50(10): 31-34.

• 新型冠状病毒肺炎(COVID-19)
• SARS-CoV-2
• 药食两用中药
• 分子对接
• 分子动力学模拟

构建药食两用中药活性成分数据库，采用分子对接方法从药食两用中药中筛选潜在的严重急性呼吸综合征冠状病毒-2(SARS-CoV-2)主蛋白酶(Mpro)抑制剂，4020种药食两用中药成分中依据亲和力排序筛选出前五名的活性成分进行进一步的分子动力学模拟计算。分子对接结果前五名为槐花皂苷Ⅰ、甘草皂苷B2、麦冬皂苷、蒲公英甾醇、穗花杉双黄酮。分子动力学模拟的结果表明结合自由能甘草皂苷B2>麦冬皂苷>穗花杉双黄酮>槐花皂苷I>蒲公英甾醇。甘草皂苷B2和麦冬皂苷有望成为SARS-CoV-2Mpro的抑制剂成分。本研究结果可为以新冠病毒主蛋白酶为靶点的药物分子设计及改造提供理论依据。

• 单位
  北京理工大学珠海学院