摘要
叶夹角直接影响水稻的光合面积和籽粒产量。挖掘水稻剑叶夹角QTL位点及其优异单倍型,为水稻剑叶夹角的遗传改良提供新QTL和种质资源。本研究以221份微核心种质资源群体作为研究材料,于2018和2019年在湖南浏阳种植,在抽穗期鉴定其剑叶夹角,利用TASSEL.5.2的MLM模型进行剑叶夹角全基因组关联分析;并利用201份水稻3K种质资源对QTL进行候选基因单倍型分析。两年共检测到6个剑叶夹角相关QTL位点,分布在水稻第5、8、9和11号染色体上,分别命名为qFLA5、qFLA5-1、qFLA8、qFLA8-1、qFLA9和qFLA11,这些QTL解释表型变异为6.23%-14.79%。对这6个QTL位点进行候选基因分析,共筛选到5个候选基因,基因功能注释分别为WRKY转录因子、钙调素蛋白等。进一步对候选基因进行单倍型分析,共筛选到5个候选基因及其相应的非同义突变优势单倍型,qFLA5候选基因Os05g0565900的优势单倍型为ACCTTCTTTG;qFLA9候选基因Os09g0412300的优势单倍型为GTGGTGTGA;qFLA11候选基因Os11g0577700的优势单倍型为ACGTGAGA。本研究结果可为水稻剑叶夹角优势等位基因的聚合及株型的遗传改良提供参考依据。
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