非洲菊CAD基因的密码子偏好性分析

作者：王星淇; 石小保; 林芳柯; 孙雪丽; 刘范; 田娜; 郝向阳; 程春振^*

来源：园艺与种苗, 2019, 39(04): 10-14.

DOI：10.16530/j.cnki.cn21-1574/s.2019.04.002

• 非洲菊
• CAD基因
• 密码子偏好性
• 异源表达

[目的]研究非洲菊肉桂醇脱氢酶基因(Cinnamyl alcohol dehydrogenase,CAD)的密码子使用偏好性。[方法 ]从非洲菊转录组数据中筛选获得具有完整CDS的CAD基因,运用CodonW、EMBOSS、SPSS和Origin软件分析其密码子使用情况。[结论]筛选获得5条具有完整CDS的非洲菊CAD基因,其密码子偏好性较弱,编码氨基酸时倾向于使用较多的A或T。GC1s、GC2s、GC3s、GC和ENC之间无显著性的相关性。该基因编码氨基酸时除受突变压力的影响外,外界因素与自然压力影响较大。酵母菌真核表达系统适合作为异源表达系统,拟南芥则是较为理想的受体。[结论]该研究可为非洲菊CAD遗传转化研究奠定基础。

• 单位
  福建农林大学