绵羊Cytb基因生物信息学分析

作者：臧胜芹; 陈晓勇^*; 杨凌; 孙洪新; 敦伟涛; 梁瑞圆

来源：江苏农业科学, 2018, 46(18): 24-27+37.

DOI：10.15889/j.issn.1002-1302.2018.18.007

• Cytb基因
• 绵羊
• 蛋白质
• 生物信息学

为进一步了解和研究绵羊线粒体细胞色素b基因的结构和功能,采用生物信息学方法构建了不同物种的Cytb基因系统发育树,并对绵羊Cytb基因编码蛋白质理化性质、二级结构、亚细胞定位、蛋白质磷酸化、三级结构等进行分析。结果表明:绵羊和山羊亲缘关系最近,其次是家牛,与原鸡、斑马鱼亲缘关系较远。绵羊Cytb基因共编码379个氨基酸,以亮氨酸含量最高;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲占为主。综合分析,此蛋白质为酸性、不稳定性疏水性蛋白质,不存在信号肽,有9个跨膜结构域,主要在内质网、细胞核、线粒体内发挥其生物学作用。该蛋白质有较多的苏氨酸(Thr)、丝氨酸(Ser)磷酸化位点和相对较少的酪氨酸(Tyr)磷酸化位点。

• 单位
  河北工程大学; 河北省畜牧兽医研究所; 生命科学与食品工程学院