基于高通量测序的大叶女贞(Ligustrum lucidum)转录组分析

作者：徐伟君^*; 张九东; 郑博文; 白群伟

来源：分子植物育种, 2019, 17(19): 6295-6299.

DOI：10.13271/j.mpb.017.006295

• 大叶女贞(Ligustrum lucidum)
• 转录组
• 高通量测序
• 基因注释

为研究大叶女贞功能基因的序列信息和表达状况,以幼嫩叶片为材料,利用Illumina HiSeqTM2500高通量测序技术对其进行转录组测序,通过序列拼接组装得到192 392个单基因簇(Unigene),平均长度为821 bp。NR库和Swiss-Prot库分别注释了88 896和61 783条Unigene。在GO分子功能、生物过程和细胞组分3大类中分别注释了12 914、12 859和7 644个基因,其中以分子功能注释最多,占38.64%;以细胞组分较少,为22.87%。本研究获得的转录组数据将为大叶女贞功能基因挖掘与利用和其种质资源遗传改良等方面的研究提供参考。

• 单位
  生命科学学院; 西安文理学院; 陕西师范大学