摘要
为了探索努比亚山羊垂体特异性转录因子1(POU1F1)与叶酸受体α基因(FOLR1)的基因多态性及其与断奶重的关联性,试验以355只努比亚山羊为研究对象,利用DNA混池法和Sanger测序法检测2个基因的候选位点;应用MTA-seq测序技术对单核苷酸多态性(SNPs)位点进行基因分型;根据分型统计结果检测Hardy-Weinberg平衡并计算群体遗传参数;利用GLM模型分析基因多态性及其与努比亚山羊断奶重的关联效应。结果表明:在POU1F1基因中检测到1个多态性位点POU1F1:g.34236170A>G,包含AA、AG、GG 3种基因型,其中AA为优势基因型,A为优势等位基因。在FOLR1基因中共检测到2个SNPs位点,其中FOLR1:g.31625869T>G位点包含TT、TG、GG 3种基因型,GG为优势基因型,G为优势等位基因;FOLR1:g.31626833G>A位点包含GG、GA、AA 3种基因型,其中GG为优势基因型,G为优势等位基因。POU1F1:g.34236170A>G位点和FOLR1:g.31625869T>G位点处于中度多态(0.25A位点杂合度较低,属于低度多态(PIC<0.25),这3个位点均达到Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。POU1F1:g.34236170A>G位点AA基因型个体第1胎断奶重显著高于GG基因型个体(P<0.05);FOLR1:g.31625869T>G位点TT基因型个体第1胎断奶重显著高于TG基因型个体(P<0.05),TT基因型个体第2胎和3胎联合断奶重显著高于TG基因型和GG基因型个体(P<0.05);FOLR1:g.31626833G>A位点AA基因型个体3胎联合断奶重显著高于GG基因型个体(P<0.05)。说明POU1F1和FOLR1基因的SNPs位点与努比亚山羊的断奶重相关,可作为山羊品种繁殖性状选育的候选基因和遗传分子标记。
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