髓母细胞瘤中预后标志物的加权基因共表达网络筛选

作者：杜宝顺; 袁磊; 孙来广; 张哲莹^*

来源：中华医学杂志, 2020, (06).

• 生物信息学
• 共表达
• 模块
• 髓母细胞瘤
• 泛素连接蛋白E2G1

目的 探讨应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法寻找髓母细胞瘤中特异表达的基因模块,筛选可能诊断和治疗髓母细胞瘤的标记基因。方法 采用WGCNA对髓母细胞瘤中与生存相关的基因模块进行鉴定。利用Cytoscape软件构建共表达网络。采用Kaplan Meier(KM)分析方法对核心基因进行生存分析。结果 根据WGCNA分析结果发现绿色模块与生存性状显著相关。对绿色模块基因进行分析结果显示,利用cytoscape软件筛选出了与生存性状相关性最大的核心基因UBE2G1,并进行了鉴定。结论 UBE2G1可能作为一个候选的诊断性生物标志物和一个有希望的治疗靶点。

• 单位
  新乡医学院; 新乡医学院三全学院; 新乡市中心医院