基于生物信息学方法分析醛氧化酶1在急性淋巴细胞白血病患者中的表达及临床意义

作者：李苗; 孔晓岩; 王淑梅^*

来源：中国临床药理学杂志, 2022, 38(24): 2946-2949.

DOI：10.13699/j.cnki.1001-6821.2022.24.004

• 急性淋巴细胞白血病
• 醛氧化酶1
• 甲氨蝶呤
• RNA修饰

目的 考察醛氧化酶1(AOX1)在急性淋巴细胞白血病(ALL)中的表达，评估其作为ALL诊断、预后和甲氨蝶呤(MTX)敏感性生物标记物的潜力。方法 基于UCSC数据库下载ALL患者和正常人的RNA测序数据，分析AOX1基因在ALL组与正常组中的表达差异。自TARGET数据集获得ALL患者的总生存期(OS)数据，基于AOX1基因表达水平分为AOX1高表达组与低表达组，分析AOX1基因表达高低对ALL患者预后的影响。基于抗癌药物敏感性基因组学数据库预测MTX半数抑制浓度(IC50),分析AOX1基因表达与MTX敏感性的相关性。根据TARGET数据集的RNA测序数据中AOX1基因与N6-甲基腺嘌呤(m6A)甲基化修饰基因表达的相关性，分析m6A修饰在AOX1基因表达调控中的作用。结果ALL组AOX1基因的阳性表达率93.18%(123例/132例),显著低于正常组98.22%(331例/337例，P<0.01),但2组AOX1基因的中位表达分别为-3.11和-3.05,差异无统计学意义(P=0.43)。AOX1高表达组的中位生存时间(26.30个月)显著劣于低表达组(70.30个月，P<0.01)。AOX1基因表达与MTX IC50显著负相关(r=-0.29,P<0.01),与多个m6A修饰基因表达显著正相关。结论 AOX1基因在ALL中低表达，与ALL预后和MTX化疗敏感性显著相关，m6A修饰可能是ALL中AOX1基因表达调控的机制之一。

• 单位
  首都医科大学附属北京世纪坛医院