肺炎衣原体阳性的非小细胞肺癌患者全基因组 DNA甲基化与lncRNA-mRNA表达分析

作者：林剑波; 杨惠敏; 徐秋萍; 邱明链; 蔡琳; 何斐^*

来源：海峡预防医学杂志, 2019, 25(06): 1-4.

• 非小细胞肺癌
• 肺炎衣原体(Cpn)
• DNA甲基化
• lncRNA
• mRNA

目的基于肺炎衣原体感染(Cpn)的非小细胞肺癌患者全基因组DNA甲基化与lncRNA-mRNA的表达情况分析,探索肺癌生物标志物。方法收集6对Cpn感染非小细胞肺癌患者的癌与癌旁组织,进行全基因组DNA甲基化芯片、lncRNA/mRNA芯片分析,筛选差异甲基化基因、差异表达的lncRNA及mRNA,将3者联合分析并进行GO分析及KEGG通路分析。结果共筛选出3 940个差异表达lncRNA,5 105个差异表达mRNA;得到11 306对lncRNA-mRNA共表达对。发现了115个差异甲基化基因,含24个DNA甲基化-mRNA关联对。最终筛选35个lncRNA/DNA甲基化-mRNA关联对,包含6个差异基因,即ZIK1、FAM184、CHRN、CPLX、NAV2和SCUBE2。GO分析及KEGG通路分析发现筛选的差异基因功能与信号通路与肿瘤发生有关。结论 DNA甲基化与lncRNA共同调控mRNA表达状态,影响ZIK1、FAM184、CHRN、CPLX、NAV2和SCUBE2等基因的功能,进一步影响Cpn感染的非小细胞肺癌的发生发展。

• 单位
  福建医科大学附属第一医院; 公共卫生学院; 福建医科大学