二穗短柄草Trihelix转录因子家族的基因组学分析

作者：胡风越; 刘廷武; 周曼丽; 周颖君; 周芮; 杨立明; 纪剑辉^*

来源：江苏农业科学, 2018, 46(18): 32-37.

DOI：10.15889/j.issn.1002-1302.2018.18.009

• 二穗短柄草
• Trihelix
• 转录因子
• 生物信息学
• 物种演变

Trihelix转录因子是一类与植物光应答反应、逆境胁迫应答和生长发育调控密切相关的转录调控蛋白家族,首先在植物中被发现。为深入了解Trihelix转录因子家族,便于植物Trihelix基因克隆并鉴定其功能,选用禾本科模式植物二穗短柄草,采用生物信息学相关方法,在二穗短柄草中鉴定出28个Trihelix转录因子家族基因,并依据蛋白保守域序列特点将其分为5个亚家族(Ⅰ～Ⅴ),这28个Trihelix转录因子基因在染色体上均有分布且出现部分聚集现象。依据二穗短柄草、水稻、高粱和玉米中聚类分析及染色体区段复制分析所得结果,判断Trihelix基因家族在二穗短柄草、水稻、高粱和玉米中的进化关系,并推测Trihelix转录因子家族在物种演变过程中发生了基因的进化。

• 单位
  淮阴师范学院; 生命科学学院