VP1蛋白结构特征预测及功能分析

作者：朱才众; 熊鸿燕; 崔步云; 李振军; 任谦; 马翔宇

来源：山西医科大学学报, 2009, (06): 485-490+571.

• EV71VP1
• 同源建模
• 生物信息学 EV71 VP1
• homology modeling
• bioinformatics

目的本文基于生物信息学方法对EV71VP1(enterovirus type71viral protein1)蛋白进行系统结构与功能预测分析。方法应用GOR4(Garnier-Osguthorpe-Robson方法)、HNN(Hierarchical人工神经网络预测法)、PHD(多重比对人工神经网络比对预测结构法)、Predator(单序列分析人工神经网络预测结构法)、SOPMA(改进型自我优化预测结构法)等方法预测EV71VP1外壳蛋白的二级结构,SWISSMODEL服务器的同源建模方法构建EV71VP1的三级结构模型,并分析亲水性、柔韧性、抗原指数、表面可能性。结果预测结果表明EV71VP...

• 单位
  中国疾病预防控制中心; 第三军医大学; 传染病预防控制国家重点实验室