甜橙NHX基因家族的鉴定及功能分析

作者：杨杰; 陈蓉; 胡文娟; 吴巧玲; 佟晓楠; 李兴涛; 陈健美^*

来源：江苏农业科学, 2022, 50(07): 35-42.

DOI：10.15889/j.issn.1002-1302.2022.07.005

• 甜橙
• NHX基因家族
• 生物信息学
• 基因表达
• 顺式作用元件

Na+/H+逆向转运(Na+/H+exchange or antiporter, NHX)蛋白家族的氨基酸序列具有Na+/H+exchange蛋白结构域，在植物生长发育和非生物胁迫应答中发挥重要作用。为探究甜橙(Citrus sinensis)NHX基因家族的生物学特性，本研究从甜橙基因组中鉴定出6个NHX基因家族成员，并对其理化性质、基序组成、进化关系、表达谱等进行分析。结果显示，CsNHXs编码蛋白的长度为407～543个氨基酸，分子量为44.71～59.97 ku;所有CsNHXs非均匀地分布在5条染色体上，均具有保守的Na+/H+exchange结构域；蛋白质二级结构分析结果表明，甜橙NHX蛋白主要以α-螺旋和无规则卷曲为主。与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)的NHX蛋白一起构建的系统进化树聚类为3个亚群，甜橙NHX蛋白分布在Endo和Vac亚群中。顺式作用元件预测分析结果表明，CsNHXs启动子区域包含多个植物的生长发育响应元件、激素响应元件和逆境响应元件。转录组数据分析结果表明，CsNHXs在甜橙不同组织中的表达存在差异性，总体上分为特异性表达和普遍性表达。本研究系统分析了甜橙NHX基因家族，为进一步阐明甜橙NHX基因家族的功能提供了理论依据。

• 单位
  国家脐橙工程技术研究中心; 生命科学学院; 赣南师范大学