恶性黑色素瘤泛素化相关基因预后风险模型的构建

作者：何海花; 左昊; 刘华丽; 宋启斌^*

来源：武汉大学学报(医学版), 2023, 44(12): 1474-1481.

DOI：10.14188/j.1671-8852.2022.0163

• 恶性黑色素瘤
• 泛素化/去泛素化基因
• TCGA
• 预后
• 风险模型

目的：基于癌症基因图谱(TCGA)数据库构建预测恶性黑色素瘤患者预后的泛素化相关基因的风险模型，并对模型的预测效能进行验证。方法：从TCGA数据库和基因型-组织表达(GTEx)数据库中下载恶性黑色素瘤样本及正常组织的基因表达信息和临床数据。通过基因集合富集分析(GESA)、单因素及多因素Cox回归分析筛选出与预后相关的差异表达泛素化基因，并以此构建预测恶性黑色素瘤患者预后的风险模型。结果：筛选出9个显著差异表达的泛素化相关基因(KCTD7、KLHL2、NCCRP1、PSME1、RNF114、SKP2、SPSB1、SYVN1、UCHL3)用于模型构建。Kaplan-Meier分析结果提示高风险组的结局较低风险组更差(P<0.001)，风险模型在预测1年、3年和5年总体生存率的ROC曲线下面积(AUC)值分别为0.775、0.743和0.785。多因素Cox回归分析表明风险评分是恶性黑色素瘤患者预后的独立预测因子(P<0.001)。结论：本研究发现由这9个泛素化相关基因构建的风险模型可以准确地预测恶性黑色素瘤患者的预后，这些基因有可能作为黑色素瘤新的生物标志物或治疗靶点。

• 单位
  武汉大学人民医院