全基因组表达谱芯片在筛选慢性牙周炎相关基因中的作用

作者：吴慧; 许诺; 王倩; 史春; 姜龙^*

来源：中国组织工程研究, 2020, 24(23): 3615-3620.

DOI：10.3969/j.issn.2095-4344.2723

• 慢性牙周炎
• 全基因组表达谱芯片
• PI3K
• Akt
• GO分析
• 上调基因
• 下调基因

背景:全基因组表达谱芯片是一种用于基因表达研究的技术手段,具有高度敏感性以及特异性,它可以在全基因组范围内检测与慢性牙周炎相关的差异基因,从而高效快速地发现与慢性牙周炎密切相关的因子。目的:应用全基因组表达谱芯片筛选慢性牙周炎相关基因。方法:选取15例正畸拔牙患者正常牙周膜组织作为对照组,21例慢性牙周炎患者牙周组织。比对4例慢性牙周炎组织和4例正常组织的全基因组表达谱芯片,筛选出上调基因及下调基因。通过Real-TimePCR(7例正常及13例患者)和Western Blot(4例正常及4例患者)对2组牙周膜组织中差异基因PI3K-Akt信号通路的表达进行验证。实验方案由海南医学院第一附属医院伦理委员会批准(批准号:HNM20180034)并获得所有患者的知情同意。结果与结论:①全基因组表达谱芯片结果分析发现慢性牙周炎样本中均存在显著差异表达的上调基因1 565个,下调基因1 849个;②富集分析发现其中在慢性牙周炎中PI3K-Akt信号通路表达有显著差异(P <0.001);③Real-Time PCR及Western Blot检测发现PI3K及Akt的m RNA和蛋白在慢性牙周炎中较对照组表达高(P<0.05);④结果说明,全基因组表达谱芯片在筛选慢性牙周炎相关基因的改变时具有快速且高敏感度等特点。PI3K-Akt信号通路在慢性牙周炎表达出现明显差异,为慢性牙周炎的治疗提供实验依据。

• 单位
  大连医科大学; 大连医科大学中山学院; 海南医学院第一附属医院