肝细胞癌相关长链非编码RNA差异表达的研究

作者：厉新妍; 方亮; 黄淑琳

来源：解剖学研究, 2016, 38(04): 272-281.

• 肝细胞癌
• 长链非编码RNA
• 长链非编码RNA芯片

目的分析肝细胞癌与正常肝组织中差异表达的长链非编码RNA(lncRNA),发现可能与肝细胞癌发生发展相关的特异lncRNA。方法采用lncRNA表达谱芯片技术检测5例肝细胞癌和其配对癌旁正常组织中的lncRNA,筛选出差异表达的lncRNA。运用分层聚类分析,对所有的lncRNA进行分类。最后从中选择10个lncRNA用RT-PCR进行定量验证。结果有1359个lncRNA表达水平出现显著性差异,差异倍数〉2倍。其中629个显著上调,占46.2%,其中125个表达5倍以上;730个显著下调,占53.7%,其中110个表达5倍以上。聚类分析(1)基因间lncRNA有11706条,其中与已知编码基因相距<300 kb的lncRNA共有352条。(2)增强子型lncRNA共有1802条,其中与已知编码基因相距<300 kb的lncRNA共有42条。(3)HOX基因簇共有101条。RT-PCR结果有8条lncRNA表达趋势与基因芯片结果一致。对癌组和癌旁组进行检验,有6条差异有统计学意义(P<0.05)。结论与癌旁组织比较,lncRNA肝细胞癌组织中的表达水平明显改变,可能与肝细胞癌的发生发展有关。

• 单位
  广州市第一人民医院