纳米孔测序技术在1例呼吸道感染患者病原检测中的应用

作者：林彦锋; 李逢将; 李中浤; 刘慧莹; 苑鑫; 牛文凯; 柏长青; 杜昕颖; 李鹏; 刘雪林^*; 宋宏彬^*

来源：军事医学, 2019, 43(08): 608-636.

• 纳米孔测序技术
• 宏基因组测序
• 铜绿假单胞菌
• 病原检测
• 呼吸道感染

目的探索快速识别呼吸道感染患者致病病原的方法,为临床早期诊断与治疗提供支持。方法基于纳米孔掌上测序仪MinION对1例患者肺泡灌洗液进行实时测序,用BGI测序平台对样本开展宏基因组测序,并对样本进行病原菌分离培养实验。结果基于纳米孔测序技术的宏基因组测序在55 min内即检测到铜绿假单胞菌特异序列,后续的二代测序及分离培养实验进一步证实了致病病原为铜绿假单胞菌。结论在该例病原检测中,纳米孔测序技术将检测周期缩短至12 h左右,与其他方法相比具有更短的检测周期,有望成为临床感染病原实时检测的重要辅助手段。

• 单位
  解放军总医院