基于线粒体nad1 intron 2序列的金钗石斛和混淆品亲缘关系及DNA条形码研究

作者：丁鸽; 张代臻; 丁小余; 蔡照胜; 商士斌

来源：江苏农业科学, 2018, 46(21): 38-41.

DOI：10.15889/j.issn.1002-1302.2018.21.008

• 金钗石斛
• nad1基因第2内含子
• 单核苷酸多态性
• 亲缘关系
• DNA条形码

为了建立简便、重复性高的金钗石斛的分子鉴别方法,对金钗石斛及其混淆品的亲缘关系进行分析并构建稳定的序列条形码分析,根据金钗石斛及其混淆品的nad1 intron 2序列,寻找其中存在的特异性位点并设计特异性鉴别引物,运用Mega 5. 0等软件进行遗传关系分析并构建系统进化树。根据序列中存在的单核苷酸多态性(SNP)位点及特异性鉴别引物,可在53℃的复性条件下扩增得到约400 bp的条带,将金钗石斛与其混淆品成功分开;构建的UPGMA树可以将金钗石斛及其混淆品鉴别开。SNP位点及位点特异性PCR具有高效、准确、省时的特点,有广泛的应用前景。同时,通过nad1基因第2内含子可以分析正品与混淆品之间的亲缘关系并成功构建物种分析的条形码序列,为石斛药材的鉴别提供了可靠的科学依据,也为构建更完整的DNA barcoding(DNA条形码)数据库奠定基础。

• 单位
  化学化工学院; 南京师范大学; 中国林业科学研究院林产化学工业研究所; 生命科学学院; 盐城工学院