捻转血矛线虫丙硫咪唑耐药株和敏感株转录组水平下差异基因分析

作者：石雅琴; 苏倩; 王腾宇; 毛晓伟; 陈昕迪; 穆嘉明; 王文龙^*; 刘春霞^*

来源：中国兽医学报, 2021, 41(07): 1295-1300.

DOI：10.16303/j.cnki.1005-4545.2021.07.11

• 捻转血矛线虫
• 丙硫咪唑
• 耐药性
• 单核苷酸多态性

首先筛选捻转血矛线虫丙硫咪唑敏感株和耐药株单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)信息,然后从比较转录组测序数据中筛选出4个丙硫咪唑耐药相关突变基因HCON00192020、HCON00037800、HCON00129090和HCON00178650,并进行生物信息学分析,最后对差异基因进行PCR扩增并测序。结果显示,共筛选到41个具有SNP位点的基因,选择reads≥10的4个基因进行后续基因扩增和生物信息学分析。扩增后目的条带大小均正确,测序后显示HCON00192020基因在3个耐药虫株中第266位均由T突变为C,HCON00037800基因在3个耐药虫株中第179、182、188位均由A突变为G,HCON00129090基因在3个耐药虫株中第283位由G突变为A,HCON00178650基因在3个耐药虫株中第89位均由C突变为A,突变结果均与转录组测序结果一致。

• 单位
  农业部; 内蒙古农业大学