哈尔滨市G9型A组轮状病毒VP7基因序列分析与探讨

作者：任莉娜; 杜溪乔; 王建; 张炳丽; 李晓鹏

来源：中国病毒病杂志, 2013, (03): 224-227.

DOI：10.16505/j.2095-0136.2013.03.001

• A组轮状病毒
• G9型
• VP7基因 Group A rotavirus
• G9 type
• VP7 gene

目的了解哈尔滨市G9型A组轮状病毒与国内外部分地区G9型毒株VP7基因序列遗传与变异的差异,丰富我国G9型A组轮状病毒VP7基因序列的基础资料。方法通过一步法RT-PCR获得了1株G9型A组轮状病毒VP7蛋白的cDNA片段,对其进行扩增、克隆、测序,用DNASTAR生物软件对其进行序列分析,同时采用参比毒株分组的方法进行序列比对。结果该G9型哈尔滨地方株VP7基因为1 061个碱基,推导326个氨基酸;与中国北京株BJ-CR531进行氨基酸序列比对,一处变异位点在aa221[丝氨酸(Ser)→甘氨酸(Gly)],发生在C区;在分组比对中,哈尔滨G9型毒株所在组的标志性位点在aa8和aa65,均...

• 单位
  哈尔滨市疾病预防控制中心