微阵列数据的多重比较

作者:荀鹏程; 赵杨; 柏建岭; 易洪刚; 于浩; 陈峰
来源:中国卫生统计, 2006, 23(01): 5-8.
DOI:10.3969/j.issn.1002-3674.2006.01.002

摘要

目的介绍阳性结果错误率(FDR)及相关控制方法在微阵列数据多重比较中的应用。方法用BH、BL、BY和ALSU四种FDR控制程序比较了3226个基因在两组乳腺癌患者中的表达差异。结果四个程序在各自实用的范围内均将FDR控制在0·05以下,检验效能由大到小的顺序为:ALSU>BH>BY>BL。ALSU程序因引入m0的估计,更为合理,不仅提高了检验效能,同时又较好地控制了假阳性错误。结论在微阵列数据的比较中必须考虑FDR的控制,同时又要考虑提高检验效能。多重比较中,控制FDR比控制总I型错误率(FWER)检验效能高,且更为实用。

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