在教育部的推动与倡导下,关于在新形势下新农科的涉农专业课程的改革实践已在全国各所高校展开。文章以适应新农科背景下的科学技术和产业发展变革为出发点,以引领新兴水产科学生态养殖发展为改革导向,为培养卓越农林人才,建设一流专业的“双万计划”而对水产微生物学的课程改革与创新进行初步探讨。研究根据“新农科建设八大行动举措”中课程改革创新行动的指导方针,着重于如何完善水产微生物学的课程创新教学体系,以期能为我国新农业发展提供具有创新意识、创新能力和科研素养人才的本科教育奠定基础。