基于网络成分分析的阿尔茨海默症靶基因动态表达研究

作者：孔薇; 崔地博; 牟晓阳

来源：中国生物医学工程学报, 2013, (04): 418-425.

• 阿尔茨海默症
• 网络成分分析
• 转录因子
• 动态网络结构 Alzheimer's disease
• nonnegative matrix factorization
• microarray gene expression data

解析转录因子与靶基因之间相互调节的关系并构建转录调控网络,对研究阿尔茨海默症(AD)的致病机理、早期诊断及制药等具有重要意义。网络成分分析(NCA)是一种能够动态预测转录因子活性并表现其影响关系的方法。本研究利用转录因子对靶基因的调控作用,及基因在AD不同病程中表达的先验知识和生物数据,通过预处理AD基因表达数据,选择出10个转录因子和85个靶基因进行网络成分分析,并利用162条调控关系构建AD基因调控网络,形成和展示了转录因子对靶基因的动态调控关系和作用。通过动态预测转录因子活性及构建网络图,发现转录因子在AD疾病的不同程度的活性有明显变化趋势,其调控的靶基因变化符合AD的病理特征。如靶基因...

• 单位
  上海海事大学