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摘要
为阐明长江江豚两性免疫系统特征及免疫适应性机制，本研究以3头雌性和3头雄性长江江豚(Neophocaena asiaeorientalis)血液为实验样本,经BGISEQ-500测序平台进行mRNA和microRNA测序。结果显示,从6个样本中共获得了15878个unigenes和985个microRNAs, KEGG分析发现有1534个unigenes注释到免疫系统相关类别并显著富集于20个常见免疫通路(P<0.05)。将两性血液转录组进行比较,鉴定了539个差异表达基因(DEGs)和160个差异表达miRNAs (DEMs),其中有299个是雌偏好表达基因, 240个是雄偏好表达基因。GO和KEGG富集分析显示,雌性长江江豚中血液基因与免疫反应和能量代谢功能显著相关,而雄性长江江豚中血液基因与免疫反应和细胞生长功能显著相关。此外,通路富集分析还发现FoxO和Hippo两条免疫相关信号通路在雌性长江江豚血液中被激活。基于DEGs和DEMs的联合分析,预测了45对miRNA-mRNA负调控关系,包括13个DEMs和对应靶向关系的37个免疫相关DEGs。研究表明, microRNAs通过调控基因表达参与长江江豚两性免疫系统,且成年雌性长江江豚可能具有更强的免疫力及维持机体内稳态的能力。本研究旨在利用RNA-seq测序技术从基因表达调控水平解析长江江豚两性免疫适应性机制,并为阐释雌雄长江江豚对多样生境的适应能力从免疫角度提供新视角,同时为长江江豚保护提供科学借鉴。
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