摘要
目的 探讨CMTM2甲基化与其基因表达及肝细胞癌患者预后的关联性。方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)和基因表达谱(Gene Expression Omnibus, GEO)数据库获取CMTM2甲基化及基因表达数据,应用R软件和Perl脚本进行数据整合,对肝癌组织与癌旁组织中的CMTM2甲基化和基因表达进行相关性分析,并比较不同CMTM2甲基化水平肝癌患者预后的差异。应用Mass ARRAY核酸质谱技术分析DNA甲基化抑制剂处理前后肝癌细胞中CMTM2甲基化水平的变化,体外细胞验证DNA甲基化对CMTM2基因表达的影响。结果 CMTM2在肝癌组织中表达水平低于癌旁组织(P=0.007 5),而CMTM2在肝癌组织中甲基化程度高于癌旁组织(P<0.001)。Kaplan-Meier生存分析显示,CMTM2高甲基化患者的总生存期(HR=1.454 8, 95%CI:1.022 3~2.070 5,P=0.037)与无病生存期(HR=1.514 8, 95%CI:1.095 3~2.094 8,P=0.012)均缩短。CMTM2在启动子区域cg07153665位点发生高甲基化,使用DNA甲基化抑制剂处理后,cg07153665位点甲基化水平降低,而CMTM2表达水平上调。结论 cg07153665甲基化位点通过调控CMTM2的表达影响肝癌患者的总生存期和无病生存期,提示cg07153665甲基化位点可能是肝癌患者潜在的预后评估指标及治疗靶点。
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单位桂林医学院; 公共卫生学院