摘要
为探析F5H (阿魏酸-5-羟化酶)与HCT (莽草酸/奎宁酸羟基肉桂酰转移酶)在调控甘草细胞木质素合成中的作用及其对悬浮细胞褐化发生的影响,根据前期转录组测序结果对乌拉尔甘草悬浮细胞中F5H与HCT基因,通过PCR技术克隆得到全长序列,并进行生物信息学分析。结果表明,克隆得到的F5H与HCT均包含一个完整的开放阅读框(Open reading frame, ORF),GlF5H全长1 632 bp,共编码544个氨基酸;GlHCT全长1 299 bp,共编码433个氨基酸。两者均为亲水性蛋白,且亚细胞定位均位于细胞质中,置信度为94.1%和89%。两者氨基酸N端均无信号肽。预测F5H是含有跨膜域的蛋白质,其中跨膜区在35~57,膜内区为1~34,膜外区58~544;预测HCT没有跨膜域。qPCR分析显示F5H与HCT在褐化细胞中的表达量明显高于在正常细胞中,表明这两个基因通过引导木质素合成参与了细胞褐化反应的发生。
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