8种易裂果实中果胶酶生物信息学分析

作者：刘亚令; 解潇冬; 耿雅萍; 杨俊强; 张鹏飞^*

来源：山西农业大学学报(自然科学版), 2020, 40(02): 42-53.

DOI：10.13842/j.cnki.issn1671-8151.201906070

• 裂果
• 多聚半乳糖醛酸酶
• 果胶酯酶
• 生物信息学
• 蛋白质等电点

[目的]果胶酶是裂果中的一种关键酶,在植物中主要有多聚半乳糖醛酸酶和果胶酯酶2种,本研究旨在探究其理化性质,为进一步了解果胶酶生理调控机制以及裂果的发生机制奠定基础。[方法]采用生物信息学的方法,以拟南芥为对照,对番茄、苹果、白梨、葡萄、枣、甜樱桃、甜橙、桃8种不同易裂果物种中的2种果胶酶理化性质进行分析。[结果]在8种植物中,果胶酯酶大小为536～571aa,多聚半乳糖醛酸酶大小为393～460aa,它们大部分都定位在细胞膜并且有一段长度为22aa的跨膜结构,等电点多碱性,都有多个糖基化位点,且果胶酯酶有4个高度保守基序,多聚半乳糖醛酸酶有2个高度保守的基序,在各自家族中,蛋白质结构上相似,进化关系保守。[结论]这些分析为裂果病变机理的研究及预防治理提供了理论基础,也为新品种的培育提供了新思路。

• 单位
  山西农业大学; 生命科学学院; 山西省农业科学院园艺研究所