创新创业教育是高校培养高素质人才的必要前提,如何提高“双创”教育最终成效是理工科高校亟待解决的问题。基于多学科交叉融合理念,结合地方高校“双创”教育的应用现状,构建“双创”教育质量评价的投入-产出指标体系,应用三阶段数据包络模型测度“双创”教育的执行效率。选取全国15所高校257份有效数据进行实证分析。研究表明,融合式“双创”教育在多学科应用背景下可以有效促进理论与实践知识的转化,提升创新创业长效发展机制,健全高校“双创”教育生态系统。