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摘要
【目的】内生菌在植物生长发育中发挥重要作用，分析不同品种荔枝果肉内生细菌群落结构及多样性，挖掘和利用潜在荔枝内生菌种资源，为进一步研究荔枝与内生菌互作关系提供参考依据。【方法】以6个不同品种荔枝的果肉组织为材料，PCR扩增16S rDNA的V3～V4区，利用MiSeq高通量测序技术分析果肉组织内生细菌在门、科、属和种分类水平上的群落组成及优势菌群，结合Alpha多样性分析评估内生细菌群落多样性。【结果】对6个品种荔枝果肉内生细菌16S rDNA的V3～V4区进行扩增，共获得2 139 086条序列，其平均长度为376 bp。不同品种荔枝果肉内生细菌群落在相对丰度和多样性上无显著差异。在门分类水平，变形菌门为主要优势细菌门类，其次为放线菌门。在科、属和种分类水平上，不同品种荔枝内生菌群落结构相似，但相对丰度占比不同。差异菌群分析结果显示，假单胞菌属（Pseudomonas）、果胶杆菌属（Pectobacterium）、苍白杆菌属（Ochrobactrum）和迪基氏菌属（Dickeya)在优良品种‘鹅蛋荔’‘糯米糍’和‘观音绿’中显著富集，根瘤菌属（Bradyrhizobium）和变形菌属（Snodgrassella）只在‘鹅蛋荔’中富集。根据菌群相对丰度进行聚类分析，‘观音绿’‘糯米糍’和‘鹅蛋荔’的相似性更高。Alpha多样性分析结果表明，6种荔枝果肉内生菌群仅在丰度和多样性上存在差异，但未达到显著水平。【结论】该研究首次分析了6个不同品种荔枝果肉内生细菌的群落结构，并在优良荔枝品种中发现特有的微生物类群富集现象，可为后续提升荔枝品质、开发利用内生菌提供理论依据和重要参考。
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