感染性心内膜炎与钙化性主动脉瓣疾病的相关性分析

作者：胡伟; 陈志松; 刘红明; 王红; 曾永利; 魏国清; 喻卓^*

来源：中国继续医学教育, 2021, 13(16): 107-111.

• 感染性心内膜炎
• 钙化性主动脉瓣疾病
• 差异表达基因
• 生物信息学
• 蛋白互作网络
• 关键基因

目的采用生物信息学方法分析感染性心内膜炎(infective endocarditis,IE)患者外周血和钙化性主动脉瓣疾病(calcific aortic valve disease,CAVD)瓣膜组织的基因表达谱芯片,研究两种疾病共同差异表达基因的功能及调控网络。方法采用公共数据库(GEO)中获取的IE患者外周血和CAVD患者瓣膜组织基因表达谱芯片数据,利用R软件包分析差异表达基因,采用DAVID数据库对共同差异表达基因进行基因功能和信号通路分析。通过STRING数据库进行蛋白—蛋白相互作用网络分析,Cytoscape软件筛选最关键的主效基因(Hub基因)。结果共筛选出47个共同的差异表达基因,其功能富集生物途径主要涉及免疫应答和炎症反应,主要参与金黄色葡萄球菌感染、补体和凝血级联反应、破骨细胞的分化等信号通路。构建了共同差异表达基因的蛋白互作网络,通过对互作网络的分析筛选出了4个Hub基因SYK、FPR1、S100A9和PLEK。结论利用生物信息学方法,通过整合数据分析表明IE患者外周血中存在与CAVD相关的分子物质基础。

• 单位
  昆明医科大学第一附属医院