不结球白菜富含甘氨酸RNA结合蛋白基因(BcGRP1)的克隆与分析

作者：汪影; 张昌伟; 侯喜林^*

来源：分子植物育种, 2018, 16(23): 7598-7605.

DOI：10.13271/j.mpb.016.007598

• 不结球白菜
• 富含甘氨酸RNA结合蛋白
• 荧光定量PCR
• 基因结构分析

本研究通过分子生物技术从不结球白菜(Brassica campestris ssp. chinensis)中克隆了BcGRP1,引物根据已报导的拟南芥(Arabidopsis thaliana)和大白菜(Brassica campestris ssp. pekinensis)中的同源基因序列设计。生物信息学方法分析显示BcGRP1基因编码168个氨基酸,其分子式为C1414H2323N507O612S94,分子量39 231.67 Da,等电点5.23;无跨膜结构和信号肽。BcGRP1蛋白质的N端第9～82个氨基酸之间包含有一个保守的RNA识别基序(RNA recognition motif, RRM),RRM结构域中包含两段保守的核糖核蛋白结构,被命名为RNP1和RNP2,它们是RRM的活性位点。BcGRP1基因与与拟南芥以及大白菜中同源基因所编码的氨基酸的相似性在90%以上。以不结球白菜‘49菜心’为材料,通过荧光定量PCR分析不结球白菜中BcGRP1在不同处理过程中的表达量变化,本研究结果表明BcGRP1基因的表达量在TuMV以及NaCl处理下的变化不大,该基因对霜霉病以及高温的响应较明显,在这两种处理下,BcGRP1基因都被明显上调,因此,推测BcGRP1基因在这两种胁迫处理下能够起到调控作用。

• 单位
  农业部; 南京农业大学; 作物遗传与种质创新国家重点实验室