肾透明细胞癌m6A甲基化修饰相关的lncRNA预后模型的构建与应用

作者：马天明; 王佳文; 孟令峰; 王笑男; 刘晓东; 张威; 赖世聪; 张耀光^*

来源：现代泌尿外科杂志, 2022, 27(07): 600-606.

• 肾透明细胞癌
• N6-甲基腺嘌呤
• 长链非编码RNA
• 预后模型

目的 利用TCGA数据库建立肾透明细胞癌(ccRCC) N6-甲基腺嘌呤(m6A)甲基化修饰相关的长链非编码RNA(lncRNA)预后模型，并探讨其临床意义。方法 从TCGA数据库中获取ccRCC的转录组数据和临床数据，通过Pearson相关性分析及单因素Cox回归分析筛选与m6A表达及预后相关的lncRNA。将配有完整生存资料的数据随机分为训练集和验证集，训练集采用LASSO回归分析确定关键lncRNA并构建预后模型、计算风险评分。根据风险评分的中位值将训练集的患者分为高、低风险两组，绘制Kaplan-Meier生存曲线比较两组生存差异。将预后模型及临床病理参数纳入单因素和多因素Cox回归分析，构建列线图预测ccRCC患者3年及5年总生存率。并用验证集对预后模型进行验证评估。结果 共筛选出12个m6A相关的关键lncRNA(AC009948.2、AC011752.1、AC018752.1、AF117829.1、AL008718.3、AL133243.3、AL158071.5、COL18A1-AS1、DLEU2、LINC00115、RPL34-AS1及SNHG10)构建预后模型。训练集Kaplan-Meier生存曲线显示高风险组患者的总体生存期明显低于低风险组(P<0.001),并在验证集得到一致的结果(P<0.001)。多因素Cox回归分析显示年龄、肿瘤分级、临床分期及预后模型是ccRCC患者预后的独立影响因素(P<0.01)。以预后模型及临床病理特征联合构建的列线图具有良好的区分度和一致性。结论 m6A相关的lncRNA预后模型能够预测ccRCC患者的预后，有望为患者的个体化治疗提供新的参考依据。

• 单位
  中国医学科学院北京协和医学院; 北京医院