枇杷WRKY转录因子鉴定与表达分析

作者：李晓颖; 徐红霞; 陈俊伟

来源：园艺学报, 2019, (05): 939-954.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2018-01142018-0671

• 枇杷
• WRKY转录因子
• 特征分析
• 系统进化
• 组织表达

以枇杷(Eriobotrya japonica)转录组数据为材料,利用生物信息学手段对枇杷WRKY转录因子进行鉴定与特征分析。分离鉴定出33条具典型WRKY结构域的序列,CDS长度分布在492～2 040bp,命名为EjWRKY01～EjWRKY33。分组鉴定和进化树分析结果显示,枇杷WRKY转录因子可分为3大类,其中Ⅰ类数量为6个,Ⅱ类和Ⅲ类的数量分别为22和5个,其中Ⅱ类又进一步分为a～e等5个亚类。WRKY结构域分析显示,WRKY结构域高度保守,绝大多数都含有WRKYGQK七肽和锌指结构。枇杷WRKY转录因子基因组DNA全长895～3 873 bp,编码的蛋白在163～679个氨基酸范围...

• 单位
  浙江省农业科学院