系统性红斑狼疮患者PBMCs差异表达基因m6A修饰的生物信息学分析

作者：王晶; 董辉; 党洁; 霍正浩; 马占兵^*

来源：生物信息学, 2023, 1-11.

• 系统性红斑狼疮
• N6-腺苷酸甲基化
• 差异表达
• 基因
• 生物标志物

采用生物信息学方法，通过公共数据库，分析系统性红斑狼疮（SLE）N6-甲基腺苷（m6A）修饰谱系。基于公共数据建立SLE m6A传修饰表达谱，分析m6A相关的DEGs在SLE中的潜在作用；利用ADEx数据库获取DEGs，利用m6a GEO数据集（GSE173312），分析获取SLE m6A修饰谱；用DAVID对m6a DEGs进行GO/Pathway注释分析。在SLE患者中，m6a组分写入器RBM15B和擦除酶FTO的表达下调，阅读器IGFBP3的表达上调。SLE m6a修饰谱包括181个基因，其中123个基因的表达上调，58个基因的表达下调。这些基因主要参与了细胞凋亡和细胞周期通路、I型干扰素信号通路、DNA复制和B细胞MHC II分子调节等生物学过程。SLE患者的PBMCs细胞m6a修饰存在异常，并可能参与疾病的发生和发展。

• 单位
  基础医学院; 宁夏医科大学; 宁夏医科大学总医院