德国小蠊变应原BgGSTD1的抗原表位特征及三维结构建模

作者：张伟; 胡玉静; 金珊珊; 杨海伟; 魏继福; 何韶衡

来源：江苏大学学报(医学版), 2011, 21(01): 18-22.

DOI：10.3969/j.issn.1671-7783.2011.01.005

• 德国小蠊
• 谷胱甘肽转移酶
• 抗原表位
• 三维结构建模

目的:通过生物信息学方法了解德国小蠊变应原BgGSTD1的结构特征,为蟑螂变态反应性疾病的诊断和治疗提供线索。方法:在NCBI数据库中获得BgGSTD1蛋白序列,Blast得到其相似序列,并应用Clustalx 1.83构建同源进化树,联合应用DNA Star多种方法预测其抗原表位,在Scan Prosite数据库中进行Motif预测,并应用SWISS-MODEL服务器进行自动建模,得到其三维结构。结果:德国小蠊BgGSTD1与美洲大蠊谷胱甘肽转移酶在进化上具有较近的亲缘关系。BgGSTD1主要为α+β结构的混合蛋白,其主要抗原表位集中于9-10,58-61,79-81,86-87,179-180,189-190,216。Motif预测其具有一个谷胱甘肽转移酶N-末端区和谷胱甘肽转移酶C-末端区。Swiss-Model服务器预测的三维结构基本能反应BgGSTD1真实的空间构象。结论:通过BgGSTD1的生物信息学分析获得了该变应原分子特征及三维结构模型,为进一步了解和掌握BgGSTD1的结构功能打下理论基础。

• 单位
  南京医科大学第一附属医院