本发明公开了一种利用微生物与铁矿制备掺杂碳催化材料的方法,包括以下步骤:(1)对微生物希瓦氏菌体进行扩大培养,离心得到湿菌体,加入铁矿进行培养,使希瓦氏菌将三价铁还原成二价铁,培养后进行离心、真空冷冻干燥,得到干菌体;(2)将步骤(1)得到的干菌体进行研磨,然后在惰性气体氛围下煅烧,酸洗活化后用蒸馏水洗至pH中性,干燥后过筛得到微生物掺杂碳材料粉末。本发明增加了材料的比表面积和导电性,促进了碳催化材料氧还原性能的提高。