ROH及其在绵羊遗传育种中的应用研究进展

作者:孙丽侠; 卢曾奎; 袁超; 张丹; 刘建斌*
来源:中国畜牧兽医, 2023, 50(08): 3258-3266.
DOI:10.16431/j.cnki.1671-7236.2023.08.023

摘要

连续性纯合片段(runs of homozygosity, ROH)是基因组中的一段长纯合片段,不同长度的ROH和个体与共同祖先的亲缘背景相关联,亲缘关系越远ROH片段越短。在近交过程中,随着世代数的增加,子代个体从共同祖先遗传得到的ROH会被不断地打断重排。在整个遗传信息传递过程中,可以根据ROH的长短来判断个体间亲缘关系的亲近程度。ROH受种群近交、种群瓶颈、基因组特征、人工选择等多种因素的制约,这些制约因素会在其基因组上留下各种印记。ROH中有丰富的遗传信息,促使ROH成为研究绵羊基因组信息的新手段。近年来,随着高通量测序技术的发展,研究人员利用基因组ROH来评估近交程度和遗传多样性、推断种群结构和种群历史、筛选和鉴定重要经济性状功能基因,进行个体选择并追踪选择信号。因此,笔者就ROH产生原理、影响因素、检测方法及其在绵羊遗传育种中的应用等方面进行综述,以期能准确制定绵羊种质资源保护策略,为ROH在绵羊遗传育种中的应用提供理论依据。

全文