山茶亚属植物DNA傅立叶红外光谱分析

作者：邱璐; 关德红; 范树国; 徐文博

来源：楚雄师范学院学报, 2019, 34(03): 34-45.

• 山茶亚属
• DNA
• 傅立叶红外光谱(FTIR)
• 主成分分析
• 系统聚类
• 亲缘关系

以山茶亚属77种茶花物种为实验材料,采用改良CTAB法提取植物基因组DNA,使用傅立叶红外光谱数据系统聚类数学模型进行山茶亚属亲缘关系分析。选取2000～500 cm-1波段的红外光谱原始数据、标准化数据、一阶导数、二阶导数、1700～700 cm-1波段二阶导数、二阶导数主成分进行系统聚类分析。研究结果显示:(1)所提山茶亚属植物DNA分子在1760～1480 cm-1、1440～1330 cm-1、1250～1000 cm-1、1000～800 cm-1峰位均有典型的DNA傅立叶红外光谱特征峰。(2)一阶导数系统聚类总辅助率为42.9%,实验样品分为四个组,系统聚类效果相对较佳;原始数据系统聚类总辅助率为54.3%,实验样品被分为三个组;二阶导数主成分系统聚类总辅助率为22.1%,实验样品分为四个组,但有很多样品无法分组;二阶导数1700～700 cm-1波段系统聚类总辅助率为53.2%,实验样品仅能分为两个组;标准化数据与二阶导数系统聚类结果,实验样品分不开,只能作为一个组,效果不佳。结论,植物基因组DNA傅立叶红外光谱数据系统聚类法对山茶亚属亲缘关系分析有辅助作用。

• 单位
  楚雄师范学院; 生命科学学院