REP-PCR分型法用于白假丝酵母菌群分析

作者：项明洁; 刘锦燕; 倪培华; 张华; 陈华; 倪语星

来源：检验医学, 2010, (07): 524-528.

• 白假丝酵母菌
• 重复序列-聚合酶链反应
• Agilent2100生物分析仪
• 流行趋势分析 Candida albicans
• Repetitive element-polymerase chain reaction
• Agilent 2100 bioanalyzer
• Epidemic analysis

目的运用Agilent生物分析仪对临床白假丝酵母菌进行重复序列(REP)-聚合酶链反应(PCR)分型,并分析其流行趋势。方法设计REP引物,进行PCR扩增,用DL7500 Labchip芯片在Agilent 2100生物分析仪上对产物做微流电泳,获得虚拟凝胶视图,再运用GelCompareⅡ软件对其DNA指纹图谱做聚类分析。结果白假丝酵母菌菌株指纹图谱相似度较高,>80%以上。被分析的100株临床株可分为9个基因型。结论REP-PCR的Agilent 2100同源性分析具有快速、易于操作、高重复性和高分辨率等优点,可广泛用于流行病学调查与研究。

• 单位
  上海交通大学医学院附属瑞金医院; 上海交通大学医学院附属瑞金医院卢湾分院