江西地方鸡品种线粒体DNA ND6基因的遗传多样性

作者：贾晓旭; 陈皖强; 唐修君; 樊艳凤; 陆俊贤; 马尹鹏; 黄胜海; 葛庆联; 顾荣; 高玉时^*

来源：农业生物技术学报, 2023, 31(10): 2132-2139.

• 线粒体DNA (mtDNA)
• 遗传多样性
• 鸡
• 江西
• 系统发育

江西省拥有众多的地方鸡(Gallus gallus domesticus)品种。为研究江西地方鸡品种的遗传多样性和系统发育关系，本研究采集了江西不同地区的6个地方鸡品种(安义瓦灰鸡,白耳黄鸡,崇仁麻鸡,丝羽乌骨鸡,东乡绿壳蛋鸡和余干乌骨鸡)的198份血液样本，采用PCR扩增与核酸测序技术相结合的方法对这6个江西地方鸡品种线粒体DNA (mitochondrial DNA, mtDNA)的还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(nicotinamide adenine dinucleotide, NADH)脱氢酶亚基6 (NADH dehydrogenase subunit 6, ND6)基因全序列进行了检测。结果表明，6个江西地方鸡品种的ND6基因序列全长为522 bp，共计检测到7个核苷酸多态位点，根据序列变异共确定了7种单倍型，其中Hap1为主流单倍型。核苷酸多样性、单倍型多样性和平均核苷酸差异分别为0.002 75±0.000 86、0.694±0.024和1.437。中介网络图分析显示，6个江西地方鸡品种单倍型呈星状发散分布。系统发育分析发现，丝羽乌骨鸡、东乡绿壳蛋鸡和余干乌骨鸡聚为一支，安义瓦灰鸡、白耳黄鸡和崇仁麻鸡聚为一支。以上结果表明，江西地方鸡线粒体ND6基因多态信息含量丰富，乌骨鸡可能有不同的母系来源。该研究结果为江西地方鸡遗传资源的种质保护、品种选育和鉴定工作提供了参考。

• 单位
  江苏省家禽科学研究所