池塘和稻田养殖克氏原螯虾肠道微生物对比分析

作者：李飞; 刘士力; 卞玉玲; 郑建波; 程顺; 贾永义; 迟美丽; 顾志敏^*

来源：安徽农业大学学报, 2021, 48(03): 423-428.

DOI：10.13610/j.cnki.1672-352x.20210706.001

• 池塘
• 稻田
• 克氏原螯虾
• 肠道微生物

为探究池塘和稻田养殖模式下克氏原螯虾肠道微生物组成的差异,采用16S rRNA高通量测序方法分析了对两种养殖模式下克氏原螯虾肠道的微生物多样性和群落结构。结果显示,所有样品共检出2 007个种水平上的分类操作单元(operational taxonomic units, OTU),归属于37个门,其中池塘养殖克氏原螯虾的肠道微生物有1 260个OTU,稻田养殖克氏原螯虾的肠道微生物有1 840个OTU,两种模式下克氏原螯虾的肠道微生物共同的OTU有1 093个;两种模式下的肠道微生物优势菌均为厚壁菌门,其中池塘模式中占比67.40%,稻田模式中占比为32.69%;对两种模式的克氏原螯虾肠道微生物进行Alpha多样性分析显示,池塘养殖克氏原螯虾肠道微生物多样性的Shannon、ACE和Chao指数均低于稻田养殖克氏原螯虾肠道微生物的指数,差异均达到极显著的水平;物种差异分析显示,在门水平上有21个门差异达到显著水平,其中有12个门差异达到极显著水平;在OTU水平上,有364个OTU差异达到显著水平,其中有106个OTU差异达到极显著水平。研究表明,池塘和稻田养殖克氏原螯虾肠道微生物在物种组成上、多样性上都存在明显差异,针对两种模式的养殖管理应有所区分,由于池塘模式下肠道微生物多样性较低,因此,需要更多地注重虾类健康状况动态,加强管理。

• 单位
  浙江省淡水水产研究所