高通量测序分析钙化性肌腱炎患者microRNA表达谱的差异

作者：赵喆; 刘建全^*; 邓志钦; 李文翠

来源：深圳中西医结合杂志, 2021, 31(04): 1-203.

DOI：10.16458/j.cnki.1007-0893.2021.04.001

• 钙化性肌腱炎
• microRNA
• 高通量测序
• 生物信息学

目的:探讨microRNA在钙化性肌腱炎(CT)患者中的表达差异。方法:选取2019年10月至2020年5月在深圳市第二人民医院骨科确诊为CT并接受手术治疗的患者4例,每例患者均取其炎症肌腱组织(CT组)及炎旁正常组织(Ctr组),提取总RNA并进行转录组测序,采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术进行深度测序,筛选在两组组织中差异表达的microRNA,并进行功能分析。结果:与正常肌腱组织比较,在P<0.05、log2差异倍数(FC)绝对值≥2条件下,CT组共有760个microRNA表达有显著差异。其中104个microRNA的|log2(FC)|>2,其中24个显著上调,80个显著下调。上调表达最明显的是miR–3529–5p,为5.9136倍。在下调表达最明显的是miR–486–5p,为10.0018倍。该类microRNA调控的COL1A1、GOLGA2、S100A16、SOX9、FOXO1等靶基因与离子结合和转运、钙通道活性、蛋白激酶活性和代谢功能密切相关。结论:CT组织与正常肌腱组织microRNA表达谱存在明显差异,差异表达的microRNA可能在CT的形成中具有重要作用,为继续研究这些microRNA在CT中的作用机制打下基础。

• 单位
  深圳市第二人民医院; 深圳大学