低氧预适应小鼠外泌体miR-126-3p的生物信息学分析

作者：巴德仁贵; 崔钧贺; 鲍牧兰; 贾小娥; 谢伟; 曹晓宇; 邵国^*

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(10): 4782-4790.

DOI：10.13417/j.gab.039.004782

• 低氧预适应
• 外泌体
• miR-126-3p

为了探讨小分子非编码RNA-126-3p在低氧预适应小鼠血液外泌体中的表达变化。小鼠随机分为常氧组(对照组)和低氧预适应组(实验组),提取血液外泌体总RNA进行高通量测序,选取差异表达miRNA,运用生物信息学方法分析生物学过程、分子功能、生物途径、信号通路及其直接作用的靶基因预测和分析。采用实时荧光定量PCR (Real time-PCR)技术检测miR-126-3p和直接作用靶基因的表达水平变化。根据高通量测序结果筛选出差异表达miR-126-3p作为候选基因,实时荧光定量PCR结果显示,外泌体miR-126-3p表达趋势与测序结果一致,相对常氧组,低氧预适应组中的表达量下降,筛选出低氧神经保护相关靶基因(HIF1α)并检测不同处理组中相对表达量呈下降趋势。低氧预适应下调miR-126-3p的表达,正调控靶基因HIF1α的表达。

• 单位
  包头医学院; 中心实验室; 首都医科大学; 宣武医院